Partie 1 : Les enzymes, biomolécules catalytiques
Chapitre 1 : Structure et classification des enzymes
1. Définitions
Enzymes (Ez) : protéine douée d’activité catalytique spécifique permettant la transformation de substrat en produit => biocatalyseur
Substrat (S) : molécule qui entre dans une réaction pour y être transformé grâce à l’action catalytique d’une Ez.
Produit (P) : molécule qui apparaît au cours d’une réaction catalysé par une Ez.
Ligand : corps chimique ayant une liaison spécifique avec une protéine
Réaction type
Exemple de réaction :
2. Structure des Ez
2.1. Nature et organisation
Une enzyme est une protéine globulaire, de masse moléculaire élevé, d’environ 104 à 2.106 Da.
Ex : Ribonucléase 124 AA => 13700 Da
Glutamate DH 850 AA => 2.106 Da (complexe multienzymatique)
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Enzyme |
Nbre de polypeptide |
Exemple |
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Monomérique |
1 |
Lysozyme (129 AA) |
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Oligomérique |
Plusieurs |
LDH (4), glutamate DH (8) |
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Enzyme |
Composition |
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Holoprotéine |
Protéine seule |
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Hétéroprotéine |
- Apoprotéine (protéine) - Cofacteur (non protéique) : - coenzyme (organique) - cofacteur minéral |
Un cofacteur est un corps chimique intervenant obligatoirement dans une réaction chimique :
- pour transporter ou compléter un S
- pour accepter un P
- comme participant à la structure de l’Ez
CoEz : molécule organique non protéique synthétisée par les cellules et indispensable à l’action de l’enzyme.
Ex : Cu2+ pour les oxydases, Mg2+ pour l’ADN polymérase
Le cofacteur minéral n’est pas modifié au cours de la réaction, tandis que le CoEz peut être réduit, par exemple.
Soit, en organisation possible d’une enzyme :
- protéine seule
- ApoEz + CoEz
- ApoEz + cofacteur minéral
- ApoEz + CoEz + cofacteur minéral
